Septembre 2003 - n°80
Innova PROTEOMICS : spécialiste de la protéomique
à haut débit…
Plus qu’un simple prestataire de services en protéomique, l’équipe
Innova PROTEOMICS s’est constituée pour proposer aux acteurs
de la pharmaceutique, des biotechnologies et de la recherche académique,
un accompagnement complet et personnalisé de leurs programmes R&D.
De la définition précise d’une stratégie scientifique
en protéomique, à la préparation amont des échantillons
et l’externalisation des opérations techniques difficilement
rentabilisables en interne, jusqu’aux résultats R&D et à
leurs analyses : les clients d’Innova PROTEOMICS sont assurément
comblés !
Mais, sur quels savoir-faire et expériences repose la reconnaissance
internationale de l’équipe Innova PROTEOMICS ? Quelles sont les
ressources technologiques dont l’Entreprise dispose aujourd’hui
? Comment les industriels et laboratoires académiques peuvent-ils accéder
à son expertise ?…
Interview de M. Alban POBLA, Directeur Général d’Innova
PROTEOMICS.
Une création progressive à Rennes…
“Innova PROTEOMICS a vu le jour fin 2002 sous l’impulsion
de 4 chercheurs de l'Université de Rennes 1 et de l'Inserm,
auxquels je me suis joint pour mon expérience du management et du développement
industriel et financier des entreprises ”, explique Alban POBLA.
Élément clé de cette création d’entreprise
? L’unité INSERM U435, un laboratoire spécialisé
dans l’étude de la reproduction chez le mâle, à
laquelle appartiennent 2 des fondateurs.
“ Les fondateurs d’Innova PROTEOMICS bénéficient
effectivement d’une large reconnaissance pour leurs travaux dans les
domaines de la reproduction, de la protéomique, de la génomique
fonctionnelle et de la spectrométrie de masse ”, confirme
Alban POBLA.
Fort des compétences acquises au sein de l’unité INSERM
U435, un projet industriel est né et a été récompensé
par l’ANVAR en 1999. Une première partie de ce programme, relative
à la spermatotransgénèse, a été intégrée
à la société BioProtein Technologies, tandis que la seconde,
centrée sur la protéomique, a conduit, après une phase
de maturation et de validation de certains process, à la création
d’Innova PROTEOMICS.
Fondée à Rennes il y a moins d’un an, Innova PROTEOMICS
a pu compter sur le soutien de la Technopole Rennes Atalante, de l’Université
de Rennes 1, de l’Inserm Transfert et de l’incubateur public breton
EmergYs, qui l' a d’ailleurs labellisée. “ Nous avons
bénéficié de subventions pour la réalisation d’études
en matière de marketing, de plan d’affaires et d’accompagnement
juridique ”, précise M. POBLA. “ Notre société
dispose de 300 m2 de locaux équipés à son
intention par l’Université Rennes 1… ”
Des moyens logistiques et technologiques
“ 300 m2 de locaux au sein de l’Université
de Rennes 1, dont 100 m2 de salle blanche classe 10 000, 70 m2
de laboratoire de préparation biologique, une salle informatique et
plus de 100 m2 de bureaux… ”, décrit Alban
POBLA. Une structure “ haut de gamme ” à la hauteur des
équipements qui y ont été installés depuis septembre
2002 : ceux de la plate-forme protéomique haut débit de la Genopole“
Ouest.
“ Notre équipe, sur la base de ses savoir-faire et de son
expérience, a en effet été mandatée par l’Inserm
pour exploiter en exclusivité la plate-forme de la Genopole“
Ouest ”, nous confie M. POBLA.
De fait, Innova PROTEOMICS dispose d’un parc technologique des plus
performants :
- un ensemble d’automates d’électrophorèse 2D et
de coloration des gels. L’équipe Innova PROTEOMICS possédant
un savoir-faire exclusif pour une coloration ultrasensible des protéines
compatible avec la spectrométrie de masse,
- des scanners de gel en lumière visible et en fluorescence,
- des logiciels d’analyse d’image haut-débit sur stations
PC, de traitement des données MS et d’identification de protéines,
- un robot Ettan 2D Workstation, capable d’extraire les spots protéiques
de gels 2D et de produire des échantillons déposés sur
cibles ou en microplaques et prêts à être analysés
en spectrométrie de masse,
- des spectromètres de masse (MALDI-TOF, Q-TOF…) dont certains
sont équipés de robots de chargement.
L’ensemble du plateau technique étant piloté par un LIMS
de nouvelle génération, développé selon les standards
en vigueur dans l’industrie pharmaceutique et agro-alimentaire.
Ainsi, Innova PROTEOMICS est à même de développer ses
activités selon deux axes prioritaires :
=> la valorisation de ses savoir-faire et technologies dans le cadre d’une
R&D interne,
=> la diffusion de son expertise auprès de l’industrie et
de la recherche académique au travers une large gamme de services.
Les produits et services au catalogue Innova
PROTEOMICS
" La combinaison de l’utilisation d’une salle blanche
de classe 10 000, de robots automates et d’un savoir-faire spécifique
dans les méthodes de coloration de gels précoulés, permet
à Innova PROTEOMICS de gagner par rapport aux techniques actuelles
un facteur 100 en rapidité et un facteur >500 en sensibilité
", nous explique Alban POBLA. "La qualité est également
optimisée par l’utilisation de codes barres pour assurer la traçabilité
de tous les composants du process (échantillons, réactifs, méthodes,
matériels, opérateurs)… "
Les atouts d’Innova PROTEOMICS sont donc incontestables et très
recherchés ! Mais, plus que de simples services, c’est dans le
cadre de véritables apports d’expertise que la société
ouvre son savoir-faire et ses technologies à l’Industrie comme
à la recherche académique. Ainsi, elle propose une large gamme
de prestations :
=> de l’identification de protéines
: préparation des échantillons biologiques, électrophorèse
2D, excision/digestion des spots protéiques, analyse en empreinte peptidique
par spectrométrie de masse MALDI-TOF, analyse par spectrométrie
de masse en tandem (séquençage de novo), identification bio-informatique
des protéines…
=> jusqu’à la prise en charge
complète de programmes protéomiques de grande ampleur :
“ Là, nous accompagnons nos clients, depuis la définition
en termes scientifiques de leur programme protéomique jusqu’à
la stratégie expérimentale à mettre en oeuvre. Nous les
aidons également à optimiser la préparation amont des
échantillons qu’ils veulent nous soumettre ”, nous
explique M. Alban POBLA.
Le plateau technologique d’Innova PROTEOMICS offre ensuite à
ses clients la solution idéale pour externaliser les opérations,
difficiles à rentabiliser s’ils devaient les gérer en
interne.
“ Difficile effectivement de prendre en charge à titre individuel
le coût d’acquisition et de maintenance de ces équipements
et celui des ressources mobilisées sur un spectre de compétences
aussi vaste : biologie, biochimie, spectrométrie de masse, bio-informatique…
”, poursuit Alban POBLA.
Soulignons qu’en tant que spécialiste de l’étude
de la reproduction, Innova PROTEOMICS est le premier client de ce plateau
au titre de sa R&D interne. Trois objectifs majeurs sont définis
à ce titre :
- le décryptage du protéome de la sphère génitale
mâle et femelle, dans le but notamment de découvrir, conceptualiser,
caractériser, puis valider de nouveaux agents anti-infectieux d’intérêt
général et de nouveaux marqueurs diagnostiques de cancers,
- le développement industriel de nano-mécanismes,
- la conception de logiciels et bases de données (outils de gestion
des données protéomiques, automates logiciels de plate-forme
protéomique, bases de données propriétaires de protéomes).
Plate-forme protéomique haut débit, Innova PROTEOMICS est capable
de gérer plusieurs projets de grande ampleur en parallèle, ce
que peu de sociétés sont en mesure de faire aujourd’hui
en Europe. Un atout de première importance ? L’exclusivité
qu’elle détient sur l’exploitation de son plateau technologique,
contrairement aux plates-formes universitaires, souvent partagées par
plusieurs équipes de recherche publiques et privées. “
Notre équipe possède ainsi l’entière maîtrise
des process et des équipements, et peut garantir à ses clients
une bien meilleure confidentialité de leurs projets ”, assure
Alban POBLA.
Le marché de la pharmaceutique et des biotechnologies est bien entendu
directement concerné, mais plusieurs autres secteurs d’application
pourraient également faire appel à l’expertise d’Innova
PROTEOMICS : l’industrie agro-alimentaire et les semenciers pour assurer
la traçabilité de certaines protéines dans un process
industriel (agro) ou naturel (semences – plantes), ou encore, l’industrie
du luxe (qualité du produit lors de la mise au point du process de
fabrication) et des cosmétiques (tests cliniques)…
S.DENIS